事故救援的過程是各個部門協同作戰，統一調度，將事故損失降低到最低程度的過程。指揮在事故應急救援中起著至關重要的作用，試想在救援過程中，如果指揮很快能夠發現問題，阻止事故進一步惡化，便能有效減少人員傷亡和財產損失。但是如果指揮專業知識、實戰經驗等存在缺陷，很有可能造成更大的人員傷亡財產損失。
指揮系統的原則
扁平化原則
應急救援的指揮系統不宜過大，層次不宜過多。系統過大往往導致命令出現偏差、發布命令時間過長等情況，延誤最佳作戰時機，影響事故救援效果。一般指揮系統的層次不宜超過3級，以2至3級為宜。一般為總指揮、各救援隊伍指揮、救援隊伍參戰人員三個層次。即使是國家級事故應急救援，指揮系統也應該以簡單有效為宜。
權威性與靈活性結合原則
權威性是指事故應急救援現場指揮發出的命令具有權威性，救援人員應服從并執行；靈活性是指在事故現場出現突發事件的情況下，救援人員臨時改變救援措施的變通形式。事故現場瞬息萬變，一般的小事故隨時可能轉化成爆炸、著火、大面積坍塌等重大惡性事故，危及現場救援人員，因此救援人員在進入事故現場后，應該適時根據現場變化情況，調整救援戰術。如與總指揮發出的命令有偏差，調整后應及時向總指揮匯報現場情況以及調整結果，以便進一步采取救援措施。
事故現場，原則上應堅持命令的權威性，遇緊急情況可適當采取靈活措施。
準確性原則
現場指揮發出的命令應該準確、明了、簡短，不宜發出可能產生偏差、誤解的命令，以免影響事故應急救援。
分級指揮原則
事故救援現場一般都比較混亂，因此，各救援隊伍應堅持分級指揮的原則。各專業救援隊伍指揮無權指揮其他救援隊伍，也無權越級指揮，各專業救援隊伍參戰人員只對本隊伍指揮負責，各救援隊伍指揮對總指揮負責。
以人為本的原則
救援指揮的各種命令都應該建立在以人為本的原則上。以人為本，體現在兩個方面，第一就是應該以搶救現場傷亡人員為基本原則，另一個方面體現在應充分保護救援人員的生命，不能盲目救援。
指揮中應注意的幾個問題
切忌盲目冒進
救援現場時間就是生命，指揮者往往會在沒有充分準備的條件下下達救援命令，這種情況可能會造成更大的人身傷亡，影響救援效果，甚至使救援行動陷于癱瘓。因此，指揮命令應建立在科學分析的基礎上，切忌盲目冒進。
撤退命令一定要及時下達
如預測現場情況將發生重大變化或事故將進一步擴大時，總指揮應果斷下達撤退命令，給救援人員足夠的撤退時間，減少無謂的人員傷亡。
及時準確上報事故救援進展狀態，以便總指揮部指揮
現場救援指揮，應及時將現場情況向總指揮匯報，總指揮應根據匯報情況，會同相關專家，認真研究現場情況，預測事故發展趨勢，及時作出戰術安排。
專業救援隊伍指揮應穩定作戰人員心態，消除其緊張情緒，阻止隊員因緊張情緒而產生的盲目蠻干。
指揮人員應積極參加演習，提高指揮能力
在日常的事故救援演練中，應專門有針對指揮人員的演練，以提高指揮人員的指揮能力，提高事故救援效果。
現場指揮的基本程序
事故救援現場復雜多變，但一般指揮應按照下列程序展開工作。
1．現場分析災情（包括征求專家意見）。
總指揮組織相關專業人員、專家，根據現場災害情況，綜合考慮人員分布、周邊環境、設備狀況、物料狀況等因素，分析現場事故危害程度。
2．預測事故發展趨勢，確定初步事故救援方案，制定各階段的應急對策。
總指揮組織相關人員研究預測事故可能的發展趨勢、危害范圍、危害程度，結合現場救援力量，確定初步事故救援方案，并預測可能出現的意外情況，制定意外狀況的應急對策。
3．確定各救援隊伍任務、目標，并下達至各專業救援隊伍指揮。
根據初步事故救援方案，分配各專業救援隊伍任務，下達命令，展開事故救援。
4．協調各救援隊伍，合理分配救援力量。
總指揮根據現場突發事件，及時合理分配救援力量，確保救援行動順利開展。
5．宣布救援結束。
6．事故救援行動圓滿結束后，由總指揮宣布救援行動結束，并向有關媒體介紹應急救援行動情況。
